За многолетнюю историю Сибирской ветеринарной науки сотрудники института (ВНИИБТЖ) приняли активное участие в решении важнейших государственных задач по созданию эпизоотической и продовольственной безопасности страны. К началу 30-х годов ХХ века учеными института была установлена этиология наиболее широко распространенных опасных инфекций животных, получены новые научные данные об их патогенезе, которые явились основанием для новых научных направлений. Учеными института изучены более 20 инфекций животных бактериальной этиологии и 9 – вирусной; заболевания вызываемые гельминтами, простейшими, паразитическими клещами, насекомыми, патогенными грибами. Разработаны противоэпизоотические и зоогигиенические мероприятия при болезнях крупного рогатого скота, свиней, рыб, пчел, птиц, пушных зверей, мелких домашних животных.
Результаты исследований ученых явились основой 52 рекомендаций, 152 методических рекомендаций и пособий, 33 монографий.
По материалам научных исследований коллектива института создано 87 запатентованных изобретений. Учеными института опубликовано более 3500 научных статей.
Собрана коллекция эпизоотических штаммов культур бруцелл и микобактерий с территорий разных биохимических провинций.
В настоящее время в отделе ветеринарии (ВНИИБТЖ) функционируют 5 научно-исследовательских лабораторий: лаборатория диагностических исследований и биотехнологии; лаборатория экологии; лаборатория эпизоотологии и мер борьбы с туберкулезом; лаборатория специфической профилактики бруцеллеза, лаборатория животноводства.
В отделе проводятся научные исследования в соответствии с Государственной программой и инициативными тематиками по основным направлениям: